קורס וולידציה וכיולים – שעור 10 – – 17.02.21
בקטריולוגיה אירובית – חיידקים חיים בנוכחות חמצן
שתן, נוזלי גוף, צואה, גרון
מיקולוגיה – פטריות
מיקובקטריולוגיה – חיידקי שחפת
פרזיטולוגיה
חיידקים אנארוביים
וירולוגיה
מולקולרית
Work flow:
קבלת דגימה –
זריעות – זריעה כללית – צואה, כללית, מע מין, עיניים
צביעה לפירוש (צביעת גרם )
תשובה של תרבית צריך לחכות 18-24 שעות
הזמנת בקבוקי דם – בקטק – בקבוק שלילי או חיובי – טיפול בבקבוק חיובי – קריאה תרבית והוצאת תשובות
מבחנות, מטושים, צנצנות, – רב הדגימות עוברות צביעת גרם וזריעות
גרם חיובי – כחול
גרם שלילי – ורוד
מניחים דגימה על סלייד – פיקסציה – צביעה בצבע כחול – קריסטל ויולט- טיפול יודין
מורפולוגיה: קוקים, מטגים, קוקובצילים, ויבריאו, ספירילום, ספירוצ’ט, –
צריך לזהות מושבוצ שונות על צלחות זריעה
צלחות לא סלקטיביות – כשיש מחלה קשה – כמו ספסיס, נוזלי גוף סטריליים – דם, נוזל עמוד שדרה, רקמות, איברים פנימיים – מצפים לראות פלורה נקיה – אם רואים פלורה מעורבת – כנראה היה זיהום בלקיחה.
סטפרפטקוקים, סטפילוקוקים, אי קולי, מיקובקטריה – שחפת, מיקופלסמה,
Maldi tof MS – שיטה לזיהוי חיידקים:
לייזר יורה על מושבות – הן נשרפות ויוצאים יונים – עושים זיהוי כימי MS של היונים לפי פיקים.
מכשיר עושה אנליזה (משווה לדטה בייס ) ובסוף נותן שם לחיידק.
אפשר גם לסרכז דם או שתן ולשים על טרגט.
רגישות של חיידקים: – התחילו מbroth dilution- מכינים תרבית ממושבה – עושים מיהולים של אנטיביוטיקות ןמוסיפים לכל חיידק – יודעים באיזה ריכוז הפסיק לצמוח אם בכלל.
עכשיו מורחים חיידק על פלטה מיוחדת לבדיקת עמידות – בשיטת דשא
ואז מניחים דיסקיות על אנטיביוטיקות – בודקים איזה אנטיביוטיקה עיכבה גידול, מודדים קוטר מסביב ואז נותנים פירוש – רגיש, יציב, ביניים. חשוב לדעת מידת רגישות – איזה ריכוז אנטיביוטיקה לתת.
שיטות אוטומטיות – וויטק, פניקס – כרטיסים עם חומרים שונים – שיטה סטנדרטית, יודע לפרש, מה mic
יודע לזהות עכירות
שיטות מולקולריות – לדטקציה של פטוגנים אם לשיטות רגילות לא עובדות
שיטות מלטיפלקס – מחפשים כמה פטוגנים בבת אחת – אפשר מכל מיני מקורות.
עושים pcr ונותנת שתי תשובות – מגלה חיידק שחפת ומגלה גן לעמידות לריפאמפיצין
תיקוף במיקרוביולוגיה:
האם שיטה עובדת – כשמתחילים לעבוד בשיטה חדשה במעבדה
האם שיטה עדיין עובדת – עושים אוולואציות תוך כדי עבודה כל הזמן
צריך קודם לבדוק האם יש אשור fda
מתי לתקף – בטסט חדש או כשעושים שינוי לשיטה קיימת
חיידקי atcc – קונים חיידק עם ספציפיקציות ידועות.
תיקוף של מצעים –זורעים על כמה פלטות עם חומר רגישות – משווים כמה היו עמידים – רואים איזו צלחת היתה יותר סלקטיבית – כמה היו false positive
תיקוף למבחנה – למשל מבחנה לשתן. ראו שיש שעור גבוה של תרביות מעורבות. רצו לתקף מבחנה עם תוסף מעכב – בוריק אסיד בשביל לקבל דגימה יותר סלקטיבית.
במהלך שינוע והמתנה לבדיקה חייקים צומחים במבחנה – ואלולים לקבל תרבית חיובית חוזרת.
לכן רצו לבדוק מבחנה עם חומר שמונע התרבות חיידקים. בדקו בערת חיידקים סטנדרטים והשוו בין שתי מבחנות
תיקוף של רגישות – אם קנינו דיסקית חדשה ורוצים לתקף אותה מול הדיסקית הקיימת. צריך להשוות המון חיידקים בפרמטרים של S R I.
לprecision משתמשים ב atcc
בכל תחום סופרים כמות אי התאמות.
ויש טבלאות לסיכום אי התאמות
e-test – אם יש הבדל גדול ב- mic בין שתי בדיקות