טכנולוגיות מתקדמות

סיכום שיעור 10

Naomi dauber

Naomi dauber

פרטי הסיכום

קורס: טכנולוגיות מתקדמות

מספר השיעור: 10

סיכום השיעור

20.2.2021

ד”ר איתי לזר טכנולוגיות מתקדמות ברפואה

שעור מס. 10

קורונה. בדיקת יעילות חיסון באמצעות מפגש סרום מחוסן עם וירוס מוטציוני. אפשרות שוירוס הקורונה מעכב סרטן. האם וירוס אונקוליטי. האם סערת הציטוקינים פועלת נגד הסרטן. תרופות נוגדות קורונה – CD24 איכילוב. דרור מבורך – הזרקת תאים מתים שמעכבים את סערת הציטוקינים.

שאלות למבחן

Pac Bio/ nanopore  – שיטת ריצוף. היתרון ארך הרצף שניתן לעבוד עליו. ממש גנים שלמים. בשיטה אנזים נתפס על הרצף וכל פעם שמצרף נוקליאוטיד מתקיים סיגנל חשמלי אופייני לנוקליאוטיד הספציפי.

Nanostring technologies שיטת זיהוי. טכנולוגית היברידיזציה. עם 7 סמנים פלורוסנטיים שונים. לא PCR  ולכן לא מכניסה טעויות של הגברה. בגלל המגבלה בפלורוסנציה אפשרות ל900 קומבינציות בלבד. עברו לכן לברקוד של רצפים.

NGSשיטת ריצוף. התהליך –מיצוי, חיתוך והוספת תג טרנספוזום (חותך ומוסיף רצף של עצמו), שפיכה ל flowcell=זכוכית עם 2 סוגי אוליגו (פריימרים). הגברה של רצפים 70 bp רצף ספציפי באיזור ספציפי. מעקב באמצעות פלורוסנציה ספציפית לכל נוקליאוטיד. אנליזה ביואינפורמטיקה.

מיני קיטים לריצוף . מותאם למטרת הריצוף – כל הגן/ אקזום/rna/מתילציה.

ריצוף גן שלם – פרגמנטציה של 350-550 בסיסים. 1-2 מיקוגר’ DNA. פריימרים מתאימים לאלו על הזכוכית. אדנילציה.

ריצוף אקזום – רק לאיזור מקודד. הרבה יותר זול.

Rna –בד:כ מעונינים בmRNA . במקרה אנושי מתחיל בפולי A.

ספריה – חשוב להתחיל עם חומר באיכות גבוהה. ניתן להשתמש במאגרי NGS קיימים. ניתן להקפיא ולהשתמש בעבודות נוספות.

מכשירי ריצוףשל אילומינה:  Myseq – תהליך ריצוף ארוך ומדויק . Nexseq – תהליךקצר יותר אך מדויק פחות. 3 ימים לעומת 2.

עריכת הסיכום

iw עִבְרִית
X