טכנולוגיות מתקדמות

סיכום שיעור 10

Lizbaruch

Lizbaruch

פרטי הסיכום

קורס: טכנולוגיות מתקדמות

מספר השיעור: 10

סיכום השיעור

בהרצאה דיברנו על שיטות ריצוף דנא שונות :

NANOPORE– יתרונות השיטה:

  • פותר וריאציות מבניות מורכבות ואזורים חוזרים
  • מפשט את הרכבת הגנום דה נובו
  • משפר זיהוי metagenomic של מינים קרובים זה לזה ומבחין בין פלסמיד לגנום
  • מאפשר ריצוף של חיידקים שלמים בקריאות בודדות – בזמן אמת

הטכנולוגיה עובדת כך שהיא מאפשרת ריצוף ישיר בזמן אמת של שברי DNA או RNA ארוכים. זה עובד על ידי ניטור שינויים בזרם חשמלי כאשר חומצות גרעין עוברות דרך ננו-חלבון. האות המתקבל מפוענח כדי לספק את רצף ה- DNA או ה- RNA הספציפי.

טכנולוגיית NANOSTRING:

יתרון- לא משתמשת בpcr  אלא בrna כלומר- מה שיש זה מה שרואים

חסרון- כמות הבסיסית בהם ניתן להשתמש

הפתרון- החלפה של חומרים פלאורוסנטים ברצף- ברקוד שמרצפים אותו וככה אין גבול לכמות הסמנים שניתן לבדוק

NGSNEXT GENERETION SEQUENSING:

טכנולוגיית ריצוף  המכונה ריצוף הדור הבא חוללה מהפכה בעולם מדעי הביולוגיה. עם התפוקה הגבוהה במיוחד, המדרגיות והמהירות שלה, NGS מאפשרת לחוקרים לבצע מגוון רחב של יישומים וללמוד מערכות ביולוגיות ברמה שמעולם לא הייתה אפשרית. שאלות המחקר הגנומי המורכבות של ימינו דורשות עומק מידע מעבר ליכולתן של טכנולוגיות רצף DNA מסורתיות. NGS מילא את הפער הזה והפך לכלי מחקר יומיומי לטיפול בשאלות אלה.

יתרונות השיטה:

טכנולוגיית NGS שינתה באופן מהותי את סוגי השאלות שמדענים יכולים לשאול ולענות עליהן. הכנת מדגמים חדשניים וניתוח נתונים מאפשרים מגוון רחב של יישומים:

  • ריצוף גנומים שלמים במהירות
  • ריצוף עמוק של אזורי יעד
  • שימושברצף RNA (RNA-Seq) כדי לגלות גרסאות RNA חדשות ואתרי אחוי, או לכמת mRNAs לניתוח ביטוי גנים.
  • ניתוח גורמים אפיגנטיים כגון מתילציה של DNA כולו בגנום ואינטראקציות עם DNA-חלבון
  • ריצוף ומחקר דגימות המכילות גידולים סרטניים על מנת לגלות וריאציות סומטיות נדירות, תת-שיבוטים של הגידול ועוד
  • זיהוי פתוגנים חדשים.

עריכת הסיכום

iw עִבְרִית
X