טכנולוגיות מתקדמות

שיעור 11:

עשינו סיור במעבדה וראינו מכישירי ה NGS

דברנו על וירוס קורונה ועל תרופו נגדו.

הכנת הדגימות ל NGS : חיתוך ה דנ”א או הרנ”א ע”י סינקטור או באמצעות אנזימים בצורה כימית. ואז עושים CLUSTTER GENERATION של הגנים ובונים BRIDGE AMPLIFICATION .

מעט מאוד מהרנ”א זה mRNA הרוב זה רבוזומל רנ”א ויש גם tRNA ובכך צריך לנקות אותם ולהשאר אך ורק עם ה mRNA

או ניקוי ע”י סינתזת mRNA  ע”י POLY AAA

אילומינה המכשיר מבוסס על פלורסניציה

SINGLE CELL NGS  -ריצןף ברמת תא הבודד, כל המערכות שהצגנו רואה כממוצע של ביטוי גן מסויים אך לא יכולים להיות מדוייקים ברמת התא הבודד, ברמת תא בודד נוכל לקבל המון אפליקציות שונות, תהליך מאוד מסובך , נוכל להסתכל על מרנ”א וגימוימיק דנ”א וזה הרבה פחות ספיציפי מאשר להסתכל על התא החיי . הטכנולוגיה ה הינה כמותית ופה אין סוף חלבונים שאוכל לבדוק אותם, בגלל צורת הסימון שזה ברקוד ולא פלורסנציה אין פה הגבלה למס’ החלבונים שבודקים אין גבול למס’ הנוגדנים שבודקים פה נוכל לבדוק נוגדנים על מעטפת התא וגם חלבונים תוך תאיים.

מפרידים את התאים ומכינים ספריה ברמת התא הבודד כל תא עטופה בטית שמן ועם כל תא יש ברקוד שונה שהוא רצף תחילי .ואז עושים אילומינה רגילה , מרציפים כל תא ותא ועושים אנליזה