טכנולוגיות מתקדמות

סיכום שיעור 11

2020

2020

פרטי הסיכום

קורס: טכנולוגיות מתקדמות

מספר השיעור: 11

סיכום השיעור

הוצגו מכשירי FACS שונים – אלה הסופרים בלבד ואלה האוספים והעושים שתי פעולות יחד. הוצגו מצלמות המכשיר, מעברי לייזרים, ערוצי צביעה וכד’. הוצגה תוכנת עבודה ביחידה להפרדת תאים.הוסבר תהליך הריצוף, הבדלים בין שיטות שונות למשל סנג’ר. מוסיפים נוקלאוטידים שבונים גדיל משלים עפ”י הסדר. נוקלאוטיד שנכנס אינו מאפשר המשך ריאקציה וכך נוצרים מקטעים עם נקודת עצירה ויש מילונים של כאלה שביחד תוך אנליזה מחברים לרצף. שיטה נוספת מבוססת זרימת יונים ION FLOW לדוגמא מכשיר ION ONE TOUCH. הוצג מקרה של ילד בועה עם בעיה ברפטור KR2D1 במאמרו של גיא ברקל בתאי NK.הוצגה שיאת TAQSEQ בא אוספים מקטעים של עד 900 בסיסים ומוסיפים אדפטרים על מקטעים בספריה. בודקים רק אזורים פתוחים מקודדים. משתמשים ברצפים משלימים שמתאימים לאקסונים בלבד, לגנים בלבד. הסימון נעשה ע”י ביוטין וניתן להוציא אותם בהמשך. רב רנ”א בתאים הוא RRNA  ויש להוציה אותו כדי להישאר עם מה שנדרש ולמנוע מיסוך קריאות לא ספציפיות. מצד שני POLY P עושה העשרה בעזרת BEADS מגנטיים ל- MRNA. מערכת נוספת של אנליזה של תא בודד אחד על דנא גנומי שלו או MRNA שלו, היתרון שלא ברמת רקמה ורואים שינוי בתא מסויים. מאפשר לבדוק למשל אוכלוסיית תאי CD4 בכל דגימת דם. בשיטה זו ניתן לצרף לנוגדן ררף קצר של כ-18 נוקלאוטידים וכך ליצור אינסוף קישורים כי יש אינסוף נוגדנים שונים. טכנולוגיה חדשה נוספת משתשמת ברצפי ברקוד. בשיטה בו נוגדנים עם רצף גורמים לפליטת אור ברגע שמתחברים באזור ייחודי להם וככה ניתן לקלוט אור לפי אזורים הנוצרים ע”י רובוט שקולט את הפליטה. למשל פלטפורמה GEOMX. ניתן לעשות את אותו תהליך לגוש סרטני כולו שמחולק לחתיכות ולאחר נתונים מחוברים חזרה לקבלת אנליזה תלת מימדית של הגידול.

עריכת הסיכום

iw עִבְרִית
X