טכנולוגיות מתקדמות

סיכום שיעור 11

יפעת סיידוף אלבוכר

יפעת סיידוף אלבוכר

תואר ראשון בביוטכנולוגיה עובדת במשרד הבריאות - רכזת ארצית לניסויים קליניים.

פרטי הסיכום

קורס: טכנולוגיות מתקדמות

מספר השיעור: 11

סיכום השיעור

טכנולוגיות -שיעור 10 – 15.2.2021

עשינו סיור בפקולטה  של בר אילן במעבדה וראינו את כל המכשירים שדיברנו עליהם בשיעורים הקודמים.

TRUSEQ- – יש הרבה

TRUSEQ- מקשרים את הRNA

PACBIO – צמוד לזכוכית כל נקלואוטיד  מקבלים סיגנל אחר

כל נוקלאוטיד נותן סיגנל אלקטרוני שונה גדילים גדולים רגיש אבל יש לו יכולת פחות דיוק

SINGEL CELL – מערכת שמתייחסת על הכל כמשהו ממוצע (ממוצע ביטוי)

צריך להגיע לרמת התא בודד אפשר לקבל כמה אפליקציות שונות.

מה חדש- ברמת התא הבודד -ברמת החלבון ניתן להדביק נוגדן שבסופו יש ברקוד DNA אם לוקחים את הברקוד ועושים ספריה ניתן לקבל ביטוי היתרון אין סוף חלבונים שניתן לבדוק בגלל ברקוד .

איך מגיעים  מכל הרקמה לתא בודד?

מכינים בועיות בעזרת צ’יפ מקרופלואידי

יש שלב מקדים להכנת סיפריה של הכנת הדגימה ברמת התא הבודד..

mRNA-ריצוף שלו ברמת התא הבודד

Drop -seq חתיכות בידים שבסופם יש POLY A – ברקוד עם רצפי RNA שונים- המסנגר RNA מתחבר לביד המסויים

הוא מכיל PCR הנדל שנקשר לאילומינה , CELL BARCOD ו UMI( ברקוד מיוחד) שנקשר T  שחוזר 27 פעמים.

חיסרון -יצירת התא הבודד בתוך הספרה השומנית צריך להיות מצומד לגידול.

10X GENOMIC- – יקרה מאוד

ניתן לזהות תא בודד

תאים נדירים לאיזה רקמות זה שייך

לוקחים את הרקמה וניתן לראות את פרופיל הביטוי ואיפה הוא נימצא לפי כל גן.

עריכת הסיכום

iw עִבְרִית
X