טכנולוגיות מתקדמות

סיכום שיעור 10

עבד אלכרים ח'טיב

עבד אלכרים ח'טיב

פרטי הסיכום

קורס: טכנולוגיות מתקדמות

מספר השיעור: 10

סיכום השיעור

 

טכנולוגיות מתקדמות 129760

 

סיכום שיעור 11 ביוטוכנולוגיה יום שני 22.2

 

מצגת שיעור 4 DNA/RNA  :

 

עמוד 18 :

–    DEEP SEQUENCING    NGS   :

DNA  (DNA חד גדילי) או  RNA (שהופכים אותו לcDNA) ….

חותכים לחתיכות קטנות bp150 נוקלואטידים ….

בעזרת PCR מוסיפים :

מברקוד ,  זמנית על מנת לדעת מאיפה בא, לזהות למי זה שיך. (חסר משמעות)

אדפטור , לקישור למערכת SEQUENCING למערת בILLUMINA (קישור לרצפה)

אחר כך (3. SEQUENCING) :

ואז אנחנו מוסיפים נוקלאטידים שמסומנים פלורוסנטית כל הנוקלאטידים המסומנים נמצאים באזור.

ואז הנוקלאטידים המסומנים המתאים נקשר לחתיכת הDNA

כלומר אם היה לנו בחתיכת הDNA שבמיקום הזה נוקלאטיד A אז יקשר אליו נוקלאטיד T שהינו מסון פלורוסנטית .. ואז המכשיר מצלם ב 4 פלטרים (כל הצבעים) ולכן בנקודה הספציפית שפה אנחנו נראה צבע כחול  ….. באותו זמן בחתיכת אחרת (קלסטר אחר) יתכן שיש נוקלאטיד  Gאז יקשר אליו נוקלאטיד C שהינו מסון פלורוסנטית ופה נקבל צבע כתום ….

כלומר כל נקודה זה חתיכה של DNA וכל נקודה הצבע שלה משתנה לפי הנוקלאטידים

העוקבים בחתיכה

 

המכשיר הזה רצף אחד נקשר זורק אותו ומרצף מהצד ההפוך

 

מאותו גן יש קלסטרים שחוזרים על עצמם בכך אנחנו מכסים את הגן

100 ביספרים (1 1 1 1 …) וכל אחד מהם זה הקלסטר Ω Ω Ω

 

 

 

 

עמוד 51 :

THE ION TORRENT

פה אנחנו כל פעם מכניסים נוקלאטיד אחר בקישור לנוקלאטיד לגדיל ואז יש מתח חשמלי.

מחבר לBED ואז משקע בבאריות נצורת ו100 ביספרים רגילים ומוסיפים נוקלאטיד ולפי הזרם המשתחרר ניתן לדעת איזה נוקלאטיד התחבר.

עמוד 54 כל פעם אנחנו שוטף בנוקלאטיד אחד אז נקבל זרם רק מהבאריות שיש בהם הנוקלאטיד שנקשר.

לדוגמה שטפנו את הבאריות בנוקלאטיד C  והוא נקשר רק בבארית עמודה1שורה3 , עמודה2שורה4 אז רק משם נקבל זרם וכך האלה …

 

 

עמוד 53 :

יש זרם

אין מצלמה

אין נוקלאטידים שמסומנים פלורוסנטית

אין לייזר

אין פלוריסנציה

אין אנזימים

 

 

עמוד 59 :

PACBIO

הנוקלאטיד כל פעם מקבל צבע אחר.

 

 

עמוד 61 :

NANOPORE TECHNOLOGY

כל פעם מקבל צבע אחר

 

 

עמוד 66  :

לבדוק ברמת רקמת דם. ברמת התא הבודד.

לדוגמה CD4 מכניסים נוגדן רואה CD4 במקום הפלוריסנציה

מצרף רצף ספציפי שיש רק לנוגדן הזה. וכאשר אני ארצף אז אוכל לדעת כמה נוגדנים יש בתא הזה.

מודד רקמה לתא בודד

 

 

עריכת הסיכום

iw עִבְרִית
X